日本100名城に選定された名城100選・・・67城
番号	史跡	建物	城名	都道府県	市区町村1	市区町村2	現存建築	再建建築
1	特別	国重	熊本城	熊本県	熊本市中央区	本丸	櫓、門、塀	天守、櫓、門
3	県		鹿児島城	鹿児島県	鹿児島市	城山町
4	県		島原城	長崎県	島原市	城内		天守、櫓、門
5			平戸城	長崎県	平戸市	岩の上町	櫓、塀	天守、櫓、門
6	県	国重	佐賀城	佐賀県	佐賀市	城内	門
9	国	国重	福岡城	福岡県	福岡市中央区	城内	櫓、門
12		県	府内城	大分県	大分市	荷揚町	櫓	櫓、門、橋
15	国	国重	高知城	高知県	高知市	丸ノ内	天守、御殿、門、塀
16	国	国重	宇和島城	愛媛県	宇和島市	丸之内	天守、門
17	国	国重	伊予松山城	愛媛県	松山市	丸之内	天守、櫓、門、塀	櫓
18	県	国重	大洲城	愛媛県	大洲市	大洲	櫓	天守
19	国		徳島城	徳島県	徳島市	城内		門
20	国	国重	高松城	香川県	高松市	玉藻町	櫓、門
21	国	国重	丸亀城	香川県	丸亀市	一番丁	天守、門
22	国		萩城	山口県	萩市	堀内
23			岩国城	山口県	岩国市	横山		天守
24	国		広島城	広島県	広島市中区	基町		天守、櫓、門
25	国	国重	福山城	広島県	福山市	丸之内	櫓、門	天守
26	国	国重	岡山城	岡山県	岡山市北区	丸の内	櫓	天守、門
27	国	国重	備中松山城	岡山県	高梁市	内山下	天守、塀	櫓、門
28	国		津山城	岡山県	津山市	山下		櫓
30	国	国宝	松江城	島根県	松江市	殿町	天守	櫓、門
31	国		津和野城	島根県	鹿足郡津和野町	後田	櫓
32	国		鳥取城	鳥取県	鳥取市	東町		門
33	特別	国宝	姫路城	兵庫県	姫路市	本町	天守、櫓、門、塀	門
34	国		赤穂城	兵庫県	赤穂市	上仮屋		櫓、門
35	国	国重	明石城	兵庫県	明石市	明石公園	櫓、塀
37	国		篠山城	兵庫県	篠山市	北新町		書院、門
38	国	国宝	二条城	京都府	京都市中京区	二条城町	御殿、櫓、門、塀
43	特別	国重	大坂城	大阪府	大阪市中央区	大阪城	櫓、門	天守
45	国		千早城	大阪府	南河内郡千早赤阪村	千早
46	国	国重	和歌山城	和歌山県	和歌山市	一番丁	門	天守、櫓、門、橋
47	国		伊賀上野城	三重県	伊賀市	上野丸之内	蔵	天守、門
50	国		高取城	奈良県	高市郡高取町	高取
51	特別	国宝	彦根城	滋賀県	彦根市	金亀町	天守、櫓、門	櫓
52	特別		安土城	滋賀県	近江八幡市安土町	下豊浦
54	国		小谷城	滋賀県	長浜市湖北町	伊部
55	国		岐阜城	岐阜県	岐阜市	明神洞		天守、櫓、門
58	特別	国重	名古屋城	愛知県	名古屋市中区	本丸	櫓、門、塀	天守、御殿、門
59		国宝	犬山城	愛知県	犬山市	犬山	天守	櫓、門
60	市		岡崎城	愛知県	岡崎市	康生町		天守、櫓、門
62	国		長篠城	愛知県	新城市	長篠市場
63			駿府城	静岡県	静岡市葵区	城内町		櫓、門
65		国重	掛川城	静岡県	掛川市	掛川	御殿、櫓、門（移築）、番所	天守、門
68		国重	丸岡城	福井県	坂井市丸岡町	霞町	天守
69	特別		一乗谷城	福井県	福井市	城戸ノ内町	門
70	国	国重	金沢城	石川県	金沢市	丸の内	櫓、門	櫓、門
72	国		春日山城	新潟県	上越市	中屋敷	門（移築伝承）
74	市	国重	新発田城	新潟県	新発田市	大手町	櫓、門	天守、櫓
75	国	県	上田城	長野県	上田市	二の丸	櫓	門
76		国重	小諸城	長野県	小諸市	丁	門
77	国	国宝	松本城	長野県	松本市	丸の内	天守、櫓、蔵	門
78	国		松代城（海津城）	長野県	長野市松代町	松代		櫓、門
80	国	国	高遠城	長野県	伊那市高遠町	東高遠		櫓、門
81	県		甲府城	山梨県	甲府市	丸の内		櫓、門
82	国		小田原城	神奈川県	小田原市	城内		天守、櫓、門
83	特別	国重	江戸城	東京都	千代田区	丸の内	櫓、門、番所	門
85	県		水戸城	茨城県	水戸市	三の丸
88	県	県	川越城	埼玉県	川越市	郭町	御殿
91	国		会津若松城	福島県	会津若松市	追手町		天守、櫓、門
92	国		白河小峰城	福島県	白河市	郭内		櫓、門
93	国		仙台城	宮城県	仙台市青葉区	天主台
95		市	久保田城	秋田県	秋田市	千秋公園	番所	櫓、門
97	国		盛岡城	岩手県	盛岡市	内丸
98	国	国重	弘前城	青森県	弘前市	下白銀町	天守、櫓、門
99	国	国重	松前城	北海道	松前郡松前町	松城	門	天守
100	特別		五稜郭	北海道	函館市	五稜郭町		奉行所
※色付き表示は、「100選」刊行後の建築（以下の表も同じ）

建物の中でも史実に基づかないとされる、いわゆる「模擬天守」の建つお城は、
それ自体が100名城選定上のマイナスとなりました。
そんなお城が、続100名城に沢山含まれています。
邪推ですが、これらのお城はたぶん「泣く泣く」100名城から落とされたのでしょう。
救済的な意図が感じられなくもありません。

続日本100名城に選定された名城100選・・・22城
番号	史跡	建物	城名	都道府県	市区町村1	市区町村2	現存建築	再建建築
2	国		八代城	熊本県	八代市	松江城町
7			唐津城	佐賀県	唐津市	東城内		天守、櫓、門
10			小倉城	福岡県	北九州市小倉北区	城内町		天守、櫓
11	県		中津城	大分県	中津市	二ノ丁本丸		天守、櫓、門
13		県	佐伯城	大分県	佐伯市	大手町	門、御殿（移築）
14	市		延岡城	宮崎県	延岡市	本小路
29	国		備中高松城	岡山県	岡山市北区	高松
36	国		洲本城	兵庫県	洲本市	小路谷		天守
39	市		福知山城	京都府	福知山市	字内記	櫓	天守
44	府		岸和田城	大阪府	岸和田市	岸城町		天守、櫓、門
48	県		津城	三重県	津市	丸之内		櫓
56	県	市	郡上八幡城	岐阜県	郡上市八幡町	一ノ平		天守、櫓、門
57	市		大垣城	岐阜県	大垣市	郭町		天守、櫓、門
61			吉田城	愛知県	豊橋市	今橋町		櫓
64	市		浜松城	静岡県	浜松市中区	元城町		天守、門
66			福井城	福井県	福井市	大手		門、橋
67	県		越前大野城	福井県	大野市	城町		天守、門
71		市	富山城	富山県	富山市	本丸	門	天守
73	県		高田城	新潟県	上越市	本城町		天守
79	市		高島城	長野県	諏訪市	高島		天守、櫓、門
86	県	市	土浦城	茨城県	土浦市	中央	門	櫓
94	県		米沢城	山形県	米沢市	丸の内

結局、名城100選に選定されたお城のうち、89城までが100名城か続100名城に選定されたことになります。
「名城」と呼べるお城は、100名城と続100名城でほぼ出尽くしたと言ってもよいのかもしれません。
ちなみに、100名城にも続100名城にも選定されなかった11城は以下の通りです。
知名度はあるが遺構の残りがよくないお城と、
現存建造物はあるものの小規模であったり知名度が低かったりするお城が残ったような気がします。
膳所城は移築城門が国の重要文化財に指定されているのですが、現地にないという点と、
そもそもお城自体がほぼ壊滅している点がマイナスなのでしょう。
相馬中村城などは、100名城に選ばれる価値が十分にあったお城だと個人的には思っているのですが、
どうして選ばれなかったんでしょうねえ。

日本100名城、続日本100名城に選定されなかった名城100選・・・11城
番号	史跡	建物	城名	都道府県	市区町村1	市区町村2	現存建物	再建建物
8		県重	鹿島城	佐賀県	鹿島市	高津原城内	門
40			伏見城	京都府	京都市伏見区	桃山町大蔵		天守、櫓、門
41		府	園部城	京都府	南丹市園部町	小桜町	櫓、門
42			舞鶴城（田辺城）	京都府	舞鶴市	南田辺		櫓、門
49	県	県	伊勢亀山城	三重県	亀山市	本丸町	櫓
53		国重	膳所城	滋賀県	大津市	本丸町	門（移築）
84			千葉城	千葉県	千葉市中央区	中央		天守
87			宇都宮城	栃木県	宇都宮市	本丸町		櫓
89		県	高崎城	群馬県	高崎市	高松町	櫓、門
90	県		相馬中村城	福島県	相馬市	中村北町	門
96			横手城	秋田県	横手市	城山町		天守